MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 chromosome

Total Repeats: 130416

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018693	AGT	2	6	10	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018693	GGTG	2	8	141	148	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018693	ACC	2	6	149	154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_018693	CTC	2	6	247	252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_018693	GC	3	6	257	262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018693	TTA	2	6	265	270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018693	GCCT	2	8	386	393	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018693	AGG	2	6	401	406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018693	TTTA	2	8	435	442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018693	CG	3	6	514	519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018693	CCT	2	6	538	543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_018693	ATA	3	9	574	582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018693	ATTT	2	8	587	594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018693	GGC	2	6	651	656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018693	CG	3	6	663	668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018693	CCT	2	6	687	692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018693	ATATT	2	10	704	713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018693	TCG	2	6	740	745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018693	GTG	2	6	802	807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018693	TGCC	2	8	820	827	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018693	CGG	2	6	927	932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018693	CCA	2	6	950	955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018693	T	8	8	956	963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018693	CAT	2	6	1037	1042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018693	CCA	2	6	1197	1202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_018693	CGG	2	6	1325	1330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018693	AAAG	2	8	1361	1368	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018693	T	6	6	1389	1394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018693	T	6	6	1411	1416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018693	ATC	2	6	1417	1422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018693	AAAT	2	8	1434	1441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018693	GTAT	2	8	1465	1472	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018693	AGG	2	6	1477	1482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018693	A	6	6	1487	1492	100 %	0 %	0 %	0 %	407703237
35	NC_018693	GCT	2	6	1561	1566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407703237
36	NC_018693	GAAG	2	8	1575	1582	50 %	0 %	50 %	0 %	407703237
37	NC_018693	GATT	2	8	1592	1599	25 %	50 %	25 %	0 %	407703237
38	NC_018693	GTT	2	6	1651	1656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407703237
39	NC_018693	TAA	2	6	1686	1691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703237
40	NC_018693	GAC	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407703237
41	NC_018693	GAT	2	6	1735	1740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703237
42	NC_018693	AGT	2	6	1794	1799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703237
43	NC_018693	GAT	2	6	1861	1866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703237
44	NC_018693	ATG	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018693	ATT	2	6	1984	1989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018693	AT	3	6	2012	2017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018693	TA	3	6	2040	2045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018693	TTTA	2	8	2074	2081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018693	GATA	2	8	2126	2133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018693	TAT	2	6	2138	2143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018693	ATTT	2	8	2166	2173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018693	TAA	2	6	2183	2188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018693	ATT	2	6	2227	2232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018693	ATT	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018693	AAGGG	2	10	2371	2380	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018693	AT	3	6	2435	2440	50 %	50 %	0 %	0 %	407703238
57	NC_018693	AAT	2	6	2448	2453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703238
58	NC_018693	ATT	2	6	2462	2467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703238
59	NC_018693	GAAA	2	8	2528	2535	75 %	0 %	25 %	0 %	407703238
60	NC_018693	AGA	2	6	2549	2554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407703238
61	NC_018693	AGC	2	6	2561	2566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407703238
62	NC_018693	GAAT	2	8	2581	2588	50 %	25 %	25 %	0 %	407703238
63	NC_018693	TTC	2	6	2644	2649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407703238
64	NC_018693	TTGG	2	8	2665	2672	0 %	50 %	50 %	0 %	407703238
65	NC_018693	TTA	2	6	2788	2793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703238
66	NC_018693	TAT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703238
67	NC_018693	TTC	2	6	2916	2921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407703238
68	NC_018693	AGC	2	6	2956	2961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407703238
69	NC_018693	ATG	2	6	2973	2978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703238
70	NC_018693	TA	3	6	3016	3021	50 %	50 %	0 %	0 %	407703238
71	NC_018693	TTG	2	6	3030	3035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407703238
72	NC_018693	AGT	2	6	3086	3091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703238
73	NC_018693	GAT	2	6	3162	3167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703238
74	NC_018693	TGA	2	6	3178	3183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703238
75	NC_018693	ATG	2	6	3189	3194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703238
76	NC_018693	TTA	2	6	3246	3251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703238
77	NC_018693	GCAT	2	8	3290	3297	25 %	25 %	25 %	25 %	407703238
78	NC_018693	ATT	2	6	3298	3303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703238
79	NC_018693	GAA	2	6	3306	3311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407703238
80	NC_018693	TAC	2	6	3352	3357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407703238
81	NC_018693	TA	3	6	3363	3368	50 %	50 %	0 %	0 %	407703238
82	NC_018693	CGA	2	6	3433	3438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407703238
83	NC_018693	A	6	6	3492	3497	100 %	0 %	0 %	0 %	407703238
84	NC_018693	TTTA	2	8	3510	3517	25 %	75 %	0 %	0 %	407703238
85	NC_018693	T	6	6	3603	3608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018693	A	7	7	3694	3700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018693	AT	4	8	3726	3733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018693	CTC	2	6	3771	3776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_018693	CTT	2	6	3785	3790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407703239
90	NC_018693	T	6	6	3798	3803	0 %	100 %	0 %	0 %	407703239
91	NC_018693	ATT	2	6	3804	3809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703239
92	NC_018693	AAT	2	6	3835	3840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703239
93	NC_018693	TAG	2	6	3869	3874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703239
94	NC_018693	ATAA	2	8	3875	3882	75 %	25 %	0 %	0 %	407703239
95	NC_018693	TAA	2	6	3893	3898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703239
96	NC_018693	CAT	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407703239
97	NC_018693	CAA	2	6	3998	4003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018693	ATA	2	6	4012	4017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018693	ATT	2	6	4045	4050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018693	ACA	2	6	4053	4058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018693	AG	3	6	4091	4096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018693	CTAA	2	8	4122	4129	50 %	25 %	0 %	25 %	407703240
103	NC_018693	T	6	6	4156	4161	0 %	100 %	0 %	0 %	407703240
104	NC_018693	ATGA	2	8	4210	4217	50 %	25 %	25 %	0 %	407703240
105	NC_018693	TGT	2	6	4304	4309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407703240
106	NC_018693	AAT	2	6	4366	4371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703240
107	NC_018693	TAA	2	6	4378	4383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703240
108	NC_018693	TGC	2	6	4424	4429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407703240
109	NC_018693	CTG	2	6	4510	4515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407703240
110	NC_018693	CTA	2	6	4636	4641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407703240
111	NC_018693	ATTTA	2	10	4709	4718	40 %	60 %	0 %	0 %	407703240
112	NC_018693	TAG	2	6	4963	4968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703240
113	NC_018693	GTTT	2	8	4975	4982	0 %	75 %	25 %	0 %	407703240
114	NC_018693	T	7	7	4980	4986	0 %	100 %	0 %	0 %	407703240
115	NC_018693	TAT	2	6	5020	5025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703240
116	NC_018693	GTT	2	6	5052	5057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407703240
117	NC_018693	TAT	2	6	5113	5118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703240
118	NC_018693	CTT	2	6	5119	5124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407703240
119	NC_018693	GAAG	2	8	5217	5224	50 %	0 %	50 %	0 %	407703240
120	NC_018693	AGT	2	6	5243	5248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703240
121	NC_018693	TCATAT	2	12	5269	5280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407703240
122	NC_018693	CCT	2	6	5289	5294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_018693	TAGT	2	8	5304	5311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018693	TAT	2	6	5320	5325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018693	ATATA	2	10	5335	5344	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018693	T	6	6	5392	5397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018693	AATT	2	8	5422	5429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018693	ATTTT	2	10	5433	5442	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018693	AAT	2	6	5452	5457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018693	TAT	2	6	5461	5466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018693	TTG	2	6	5481	5486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018693	TGA	2	6	5510	5515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018693	TTA	2	6	5520	5525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018693	ATG	2	6	5665	5670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018693	T	6	6	5703	5708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018693	GA	3	6	5754	5759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018693	AAT	2	6	5762	5767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018693	ACA	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018693	AAC	2	6	5818	5823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018693	TGT	2	6	5844	5849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018693	T	6	6	5874	5879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018693	AT	3	6	5890	5895	50 %	50 %	0 %	0 %	407703241
143	NC_018693	GAAAT	2	10	5910	5919	60 %	20 %	20 %	0 %	407703241
144	NC_018693	ATC	2	6	5971	5976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407703241
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